Comparar, sortear e apagar linhas duplicadas no Notepad++

Para remover linhas duplicadas  basta apertar Ctrl+ F, selecionar a aba “Substituir” e no campo “Localizar”  colocar  : ^(.*?)$\s+?^(?=.*^\1$).  Em modo de busca marcar  “Expressão  regular” e clicar em substituir todos.

Comparar Arquivos:
Primeiramente arraste um das abas que deseja ser comparada  para o lado solte   e escolha mover para outra tela.

Apos isso vá na aba Plugins –> Plugin Manager –> Procure pelo Compare e selecione ele para baixar.

Apos isso, na aba Plugins haverá um novo item chamado Compare, basta clicar em Compare ou Alt + D para o plugin funcionar.